突如、現れた謎の寄生生物。寄生した人間を奇妙でおぞましい姿に変化させ異常な行動をとらせるという…。 一方、高校生・カナタの通う学校では商店街で目撃されたという“人喰いキリン男"のウワサが広まっていた。 それは、想像を絶する惨劇の始まりだった。 謎の核心となる“オキテネムル"とは? カナタは奇妙な戦いに身を投じることになる……!

Lorsque le cadavre d’une femme-serpent est retrouvé dans la salle de cours des seconde B, le service externe d’enquête et d’analyse boucle tout le lycée et regroupe les élèves pour leur faire passer des tests... Objectif affiché : vérifier qu’aucun d’eux n’est atteint par une mystérieuse maladie contagieuse. Mais Kanata apprend rapidement qu’il s’agit en réalité d’un parasite mortel pour son hôte... Prié de mettre ses talents d’Éveillé au service de l’enquête, il découvre qu’une de ses camarades, Ayumi, a été infectée. Manipulée par le parasite, celle-ci l’embrasse alors avant de se transformer en une créature monstrueuse ! Le jeune garçon va-t-il être contaminé à son tour ?

Kanata a bel et bien été contaminé par le baiser d’Ayumi : maintenant qu’il a trouvé son hôte définitif, le parasite prend le contrôle de l’Éveillé pour le mener droit dans les griffes d’une organisation mystérieuse qui n’a pas l’air de lui vouloir du bien ! Heureusement, les agents du service d’enquête réussissent à libérer le lycéen et mettent ses kidnappeurs en fuite… Kanata accepte alors de travailler pour eux, avec Shiki pour garde de corps. Et avec tous les monstres qui traînent en ville, ce ne sera pas une mission de tout repos pour la taciturne jeune fille…

Setsu Ameno, la nouvelle fraîchement transférée dans la classe de Kanata, se révèle être une Éveillée artificielle ! Manipulée par Utainushi pour soustraire l'adolescent à la garde de Shiki, elle utilise ses pouvoirs de manière trop intense pour son corps... Et le contrecoup ne se fait pas attendre : à deux doigts de la mort, la jeune fille est sauvée in extremis par Kanata et intègre le service d'enquête. Mais pour l'Éveillé, les choses sont loin de s'arranger, car voilà que son meilleur ami, Takiji, est à son tour victime du parasite !

人の頭に侵入して快楽ホルモンを集めるゴーストの正体は、医療用の超小型ドローンの集合体だった。ゴーストは活動を阻害するガイチュー本部に侵入し、局長の綾切に襲いかかる。一方、ドローンを開発した会社に調査に出向いたカナタたちにも、危機が訪れる。事件の背景にあるものは？　ゴースト編、衝撃の完結。そして、もうひとりのオキテネムルである、シキの姉・アスに迫る新編もスタート。

もうひとりのオキテネムルでもあり、シキの姉でもあるアス。アスの死を目の前で見ていたシキに対し、カナタは「アスは生きている」と言い放つ。寄生生物に感染した親友のトキジを元に戻したいカナタと、アスを取り戻したいシキ。目的をともにするふたりに、新たな事件の足音が近づく…。

死んだと思われていたシキの姉・アスが目を覚まし、謳主の計画は次のフェーズへと進む。一方、カナタたちガイチューメンバーは、ミドリムシの力で異形の生物へと姿を変えた人々に対処するため、作戦行動を開始するが――。

ミドリムシ人間・通称ネーブを退治するため 殲滅作戦を決行するアスの前に、姉・アスが現れる。 アスの圧倒的な強さを前に、 敗れるシキ、カナタ、そしてセツ――。 甚大な犠牲を出しながらも 闘うガイチューメンバーに、謳主の影が迫る…。

謳主の人類浄化を止めるため、文歌島の巨大ネーブの中に侵入したガイチューメンバー。 シキ・カナタVSアスの壮絶なバトル、野桜VS課長のネーブを巡る戦いの最中、 国連が放った核爆弾が島に着弾し…!?オキテネムルと謳主の最終決戦、堂々完結。