Nawawala ang alagang pusa ni Ate Lotlot at ang alagang tuta ni Junjun. Ninakaw ang mga sinampay ni Aling Cora. Pinatay ang mga panabong na manok ni Mang Jimmy. Na-kidnap ang sikat na Shino Kid. May isang mangkukulam. May isang dalagitang bagong lipat. May tatlong binatilyong fans ni Detective Conan. Sila ang lulutas sa lahat ng misteryong bumabalot sa Barangay Masangkay.

Namatay si Mayor Dacanay sa mismong araw na pinarangalang Junior Detectives sina Uno, Junior, at Thirdy sa bayan ng Valenciano. Natagpuan ang Mayor sa opisina niya, sarado ang mga bintana at pinto. Walang puwedeng daanan ang suspek. Para kina Uno, Junior, at Thirdy, iisa lamang ang maaaring salarin. May isang sekretaryang nakulong; may isang anak na naulila; at may magkakaibigang lulutas sa kaso ng closed-door mystery.