人間の心理状態や性格的傾向を計測した数値、通常“サイコ=パス”によって、理想の精神状態を保つためのメンタルケアが普及し、数値を指標とする最適幸福が追求できるようになった未来世界。 犯罪者も“犯罪係数”と呼ばれる数値によって事前に判別され、“潜在犯”として裁かれていた。都市の治安維持にあたるのは、高い犯罪係数を持つ潜在犯でありながら犯罪捜査の実動を担う“執行官”と、模範的社会性を持つキャリアとして執行官の監視・指揮を担う“監視官”のチームで活動する厚生省公安局刑事課。 一係に配属された新人監視官・常守朱は、配属初日から現場に呼び出され、犯罪係数を解析し断罪する特殊拳銃“ドミネーター”を手渡される。事件解決のため、執行官とともに犯人を捜し始める朱だったが―。

正義が、終わる── 人間の精神的形質を計測した数値、通称“PSYCHO-PASS"によって、罪を犯す前に潜在犯として裁く、シビュラシステムによる絶対のルールが破られた。 社会の秩序を覆したのは、猟奇的な連続殺人を影で操り、狡噛慎也が執行官に堕ちてまで追い続けていた男・槙島聖護。刑事課一係で唯一、槙島と対峙し、数値で計れない悪意を目の当たりにした監視官・常守朱は、大きなショックの中、彼を捕らえようという気持ちを新たにする。 しかし──