Sono passati molti anni da quando l'Assassino Nikolaj Orelov è fuggito dalla Russia abbandonando così la Confraternita. Ma il suo è un passato da cui è difficile liberarsi e vecchie conoscenze riappaiono per assicurarsi che lui sia ancora fedele al credo che ha giurato di seguire. A distanza di mezzo secolo, nel presente, Daniel Cross deve capire cosa farà della sua vita ora che è tornato all'Abstergo dopo aver tradito gli Assassini.