Dans La séparation (suite du Grand incendie et second volet du "Journal de mon père"), le héros et narrateur Yoichi Yamashita continue d’évoquer son enfance et sa prime jeunesse. Il se trouve en effet dans sa ville natale de Tottori, où la famille est réunie pour l’enterrement de Takeshi, le père de Yoichi. Ses souvenirs, des images qu’il avait refoulées depuis des années, continuent d’affluer au fil des heures passées à veiller le défunt. Yoichi se rappelle les circonstances qui ont amené ses parents à la séparation, puis au divorce. Depuis le "grand incendie", Takeshi n’a fait que travailler pour rembourser une lourde dette, contractée envers son beau-père. Kiokyo, la mère de Yoichi, se sent délaissée. Elle fréquente l’instituteur de sa fille et peu à peu s’éloigne de son époux. Enfin elle décide de quitter sa famille pour aller s’installer dans une autre ville avec son amant. Elle quitte la demeure familiale pendant le sommeil de Yoichi. Ce dernier en éprouvera une immense douleur et restera blessé, solitaire et habité d’un profond sentiment d’avoir été rejeté de tous. Il tentera de rejoindre sa mère mais, en la retrouvant, il vivra une seconde déchirure. De la foule de ses souvenirs Yoichi évoquera aussi la mort de sa chienne Chiro, les vacances à la mer avec son père et sa sœur, l’adoption d’un nouveau compagnon, le chien Kiro. Takeshi, lui, finira par se remarier avec une femme gentille et dévouée. Ces récits du passé sont l’occasion pour les uns et les autres de mieux comprendre et de pardonner les erreurs commises...