Sakura la kendoka, Léon le judoka et Logan le karatéka sont invités par le célèbre maître Saburo à un stage d'arts martiaux dans son dojo. Ils découvrent par hasard, dans une ancienne boîte en laque noire, un mystérieux origami en forme d'étoile, et trois anneaux magiques. Ces derniers ont appartenu à Hiro, Eiko et Ako du clan Minamoto, des guerriers samouraïs chargés de veiller sur un trésor. En les enfilant, les trois enfants se retrouvent projetés au Japon au XVIe siècle...

Sakura, Léon et Logan ont fondé le Club des apprentis samouraïs : le CAS. Ils décident d'aller fouiller la salle d'exposition du dojo, à la recherche d'un nouvel indice. Car les enfants doivent maintenant retrouver l'arme où l'âme du jeune Hiro est enfermée... Après avoir découvert un origami en forme d'éventail, ils se retrouvent de nouveau projetés, grâce aux anneaux magiques, dans l'Ancien Japon. Mais le terrifiant ninja noir est prêt à tout pour les devancer...